Ligasi Mn-dipendenti
C-S LIGASI
Reazione in due tempi.
C-N LIGASI
Trasformazione di un monosaccaride in un amminomonosaccaride.
P-O LIGASI
Nel metabolismo degli acidi nucleici.
Saldano i punti di discontinuità che si hanno durante la duplicazione del duplex, unendo i terminali 3’ e 5’ che si affrontano. Il terminale 5’ dev’essere marcato per fosforilazione. PPi viene sequestrato da una pirofosfatasi che lo idrolizza, aumentando l’energia del sistema. La trasformazione è irreversibile. Avviene un cambiamento conformazionale che avvicina l’O dell’anidride alla sfera di coordinazione di Mn. Mn destabilizza portando via AMP; P in 5’ resta cationico e riceve attacco nucleofilo da OH in 3’, formando un legame fosfodiestereo. Sul filamento appena sintetizzato, lo scorrimento promuove quindi la saldatura del frammento.
C-O LIGASI
Reazioni ligasiche e transferasiche.
La ligasi inserisce ogni amminoacido sul proprio trasportatore specifico, il t-RNA, sul terminale 3’. Ogni amminoacido è diversificato in virtù della sequenza anticodice e delle altre anse.
aa + ATP ⇆ aa~~AMP + PPi
COOH dell’amminoacido dà attacco nucleofilo su P cationico generando un composto ad alta energia. PPi viene idrolizzato e dà ulteriore energia al sistema.
aa~~AMP + t-RNA ⇆ aa~~t-RNA + AMP
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Autore:
Marco Lazzara
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- Università: Università degli Studi di Torino
- Facoltà: Scienze Matematiche, Fisiche e Naturali
- Corso: Chimica
- Esame: Biochimica
- Docente: Carlo Giunta
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