Approcci genetici e funzionali nello studio delle leucemie linfoblastiche acute LLA

Lo studio è stato condotto su un campione di 200 individui sardi: (98 riceventi e 102 donatori), tutti rilevati nel centro oncologico Businco di Cagliari, nel periodo che va dal 2000 al 2009.
Il materiale di partenza è rappresentato da sangue periferico ed aspirato midollare, trattato con EDTA prelevato dai riceventi e dai donatori nella fase precedente il trapianto di midollo osseo. Il DNA viene estratto con il kit Roche in accordo con la metodica della ditta produttrice.La qualità del DNA così ottenuto viene controllata mediante lettura allo spettrofotometro GENE-QUANT II (Pharmacia-Biotech) e vengono presi in considerazione i valori di assorbanza, alle lunghezze d’onda di 260 e 280 nm, il valore di ratio e la concentrazione in g/l. Amplificazione tramite PCR (Polimerase Chain Reaction)
La reazione di polimerizzazione viene eseguita per ottenere un numero elevato di copie di specifiche sequenze di DNA (in questo caso marcatori VNTR e STR di nostro interesse) da una miscela di DNA genomico mediante un processo di amplificazione.
Il punto di inizio di ciascuna PCR è la miscela contenente il DNA contenente la sequenza da amplificare e due oligonucleotidi primer che fiancheggiano la sequenza d’interesse.
E’ stato utilizzato il kit commerciale AmpFlSTR (Applied Biosistem) i seguenti nove marcatori che rappresentano regioni VNTR o STR introniche o-e esoniche dei geni strutturali, sei sono STR: MCT118, PAH, APO B, APOC1, YNZ-22, e quattro VNTR: IGF1, CAR, 33.6, SE33