Analisi Proteomica di Cupriavidus metallidurans CH34: studio dell’interazione tra proteine e fasi solide del suolo

Studio del proteoma di Cupriavidus metallidurans CH34 inoculato in un tre suoli artificiali che si differenziano per il rapporto caolinite/montmorillonite. La necessità di studiare il proteoma di un batterio inoculato in suoli artificiali nasce dallʼesigenza di valutare lʼeffetto di specifiche fasi solide sullʼestrazione delle proteine dal suolo.
Lʼapproccio metodologico per lʼestrazione del proteoma di Cupriavidus metallidurans CH34 della mia tesi è stato definito da Giagnoni et al. (2011), nel quale lʼeffetto di vari minerali del suolo sullʼestrazione delle proteine era negativamente influenzato dalla presenza della montmorillonite. Nellʼambito della mia tesi, ho studiato il recupero delle proteine di Cupriavidus metallidurans CH34 posto a contatto con un suolo artificiale con una percentuale di montmorillonite di 2%, 4% e 10%, confrontando i quadri proteici del batterio, mediante un approccio di proteomica differenziale (elettroforesi bidimensionale) e spettrometria di massa.
Inoltre, per valutare specificamente lʼeffetto degli acidi umici su recupero e identificazione di specifiche proteine, ho studiato lʼinterazione di due proteine pure, α-amilasi da germe di grano e RNAsi pancreatica con acidi umici in soluzione.