Metodologie mass-spettrometriche e spettroscopiche per lo studio di sistemi di interesse biologico

INTRODUZIONE I metodi chimico-fisici sono diventati sempre più importanti nello studio dei sistemi biologici negli ultimi decenni, da quando la tecnologia ha reso possibile misure su sistemi complessi limitando al minimo le alterazioni delle condizioni naturali e rendendo quindi significativi i risultati ottenuti. Storicamente il primo grande successo della chimica fisica nello studio delle macromolecole biologiche fu la determinazione della struttura del B- DNA mediante raggi x [1], coadiuvata dalla sintesi di DNA sintetico con un metodo analogo alla sintesi di Merrifield[2] . Fu la prova sperimentale che il modello proposto nel 1953 da Watson e Crick [3]era valido. L’analisi chimico-fisica delle molecole biologiche è di fondamentale importanza nello studio dei processi biochimici, in quanto consente di comprendere a livello microscopico, almeno in teoria, i meccanismi intrinseci che governano il comportamento delle molecole chiave della vita. Tuttavia risulta spesso difficile, a causa della complessità di questi sistemi e del fatto che ogni metodologia di studio deve tenere conto delle condizioni fisiologiche del particolare sistema. Per ovviare al problema della complessità, la ricerca chimico-fisica molto spesso prende in considerazione i precursori delle macromolecole, sia perché la loro analisi risulta piu’ semplice sotto diversi aspetti, ma anche perché la comprensione dei meccanismi intrinseci non può prescindere dallo studio delle piu’ intime componenti del sistema. Altre volte si lavora confrontando i risultati ottenuti su molecole simili, ma non identiche. Questo nel tentativo di spiegare il ruolo che le singole substrutture rivestono nell’attività dell’intera molecola. In questo lavoro ci siamo occupati di due aspetti fondamentali in questo tipo di sistemi: il riconoscimento chirale e le forze di interazione non covalente. E’ noto come moltissimi processi biologici siano caratterizzati da un alto grado di selettività chirale e che l’esistenza stessa delle 1