Clathramidi A-B, due nuovi alcaloidi bromopirrolici della spugna Agelas Clathrodes. Isolamento e determinazione della stereostruttura

La Tesi sperimentale in chimica organica che ho preparato per la mia Laurea può essere semplicemente schematizzata in quattro parti fondamentali.

1. La prima parte della Tesi riguarda le tecniche di isolamento, separazione e purificazione dei due nuovi alcaloidi. Si sono utilizzati a questo fine estrattori, colonne cromatografiche, HPLC.
2. Nella seconda parte si trova la trattazione dei dati che hanno portato alla determinazione della struttura molecolare. Si è ricorso alla spettroscopia di massa, alle tecniche spettrofotometriche (U.V., I.R.) e alle tecniche NMR (spettri 1H- e 13C-NMR, spettri DEPT, esperimenti bidimensionali COSY, 1H-13C HMQC ed HMBC). In particolare, si è rivolta attenzione alla determinazione della stereostruttura delle due molecole, visto che esse differiscono tra loro solo per il fatto di essere diastereoisomeriche. La determinazione della struttura spaziale costituisce una parte centrale della Tesi e raggruppa diversi esperimenti. Informazioni univoche sono pervenute da esperimenti NMR (effetto n.O.e.), nonché da una simulazione di dinamica molecolare/meccanica molecolare dei 4 possibili diastereoisomeri (HTMD in un campo di forze CHARMm). Grazie a tutti questi esperimenti si è assegnata la stereochimica relativa SS/RR per un composto e SR/RS per l'altro. Per determinare la stereochimica assoluta, si è realizzata una reazione di idrolisi enzimatica del legame amidico, sfruttando l'enantioselettività di due enzimi (acilasi I e acilasi AA). Da qui si è potuto assegnare la stereochimica SS per la Clathramide A, mentre la Clathramide B è RS.
3. La terza parte riporta le proprietà farmacologiche che presentano le due molecole. A dispetto di analoghi alcaloidi isolati dall'Agelas, le Clathramidi A-B hanno mostrato in vitro una moderata attività anti-fungina contro l'Aspergillus niger.
4. La parte finale è una trattazione teorica della biosintesi delle due molecole che hanno un percorso bio-genetico non assimilabile ad altri alcaloidi bromo-pirrolici già noti derivanti tutti dall’oroidina.