Infezione da Human Papillomavirus (HPV) in soggetti positivi per HIV-1

E1 è l’Open Reading Frame più estesa del genoma di tutti i Papillomavirus, risulta ben conservata. Il gene E1 codifica per due polipeptidi ottenuti per splicing alternativo: una fosfoproteina nucleare di 68 KD funzionalmente attiva che corrisponde all'intera sequenza del gene; una proteina di 27 KD, codificato dalla porzione 5' del gene, inattiva e a funzione ignota.
La proteina E1 ha un’attività elicasica ATP-dipendente, che permette lo svolgimento del genoma virale per la replicazione genomica, ed un’attività ATPasica DNA-dipendente, che permette di legare il DNA in modo sito-specifico. La proteina E1 è un fattore critico per la replicazione dei papillomavirus: infatti, si lega in modo specifico all'origine di replicazione con una affinità che viene aumentata dal legame di E2.
Inoltre, E1 interagisce con la DNA polimerasi-primasi permettendo l'associazione di tutti gli altri fattori che andranno a costituire insieme all'elicasi virale il complesso di inizio della replicazione . Domini amino- e carbossiterminali sono implicati nel legame ad E2 ma numerosi studi hanno indicato che il dominio C-terminale di E1 è sufficiente per l’interazione con TAD (Trans Activation Domain) di E2, ma non così efficiente come l’intera proteina.
L’RNA messaggero da cui HPV-18 è espresso non è noto. È stato dimostrato che in cellule eucariotiche, E1 è espressa da trascritti policistronici contenenti le ORFs di E6, E7 ed E1. La traduzione di E7 ed E1 non è associata: è attuata da popolazioni di ribosomi separate.
Uno stampo policistronico è complicato per l’operato dell’apparato ribosomiale. La traduzione di E1 avviene mediante un meccanismo di scansione in cui gli effettori sono subunità ribosomiche di 40S che cooperano con fattori di traduzione cellulare. La probabile ragione per cui la proteina è espressa secondo questa modalità, che è stata trovata essere poco efficiente e molto complessa, è che l’uso di trascritti policistronici potrebbe essere una via regolare i livelli di proteine virali che sono richieste a bassi livelli.