Proteomica comparativa applicata allo studio di specifici profili proteici
Il presente lavoro di tesi verte sull’analisi proteomica di un pool proteico estratto da fibroblasti espiantati da quattro soggetti: due controlli sani e due pazienti affetti da Parkinson’s disease nella variante autosomica recessiva.
Tale studio si realizza mediante l’applicazione di tecnologie quali:
• Elettroforesi bidimensionale;
• Spettrometria di massa.
L’analisi della mappa proteomica di tale pool ha focalizzato la nostra attenzione su un cluster di spot caratterizzato da un pattern di risoluzione caratteristico: si tratta di tre spot che migrano come “pearl chain “. Essi occupano sulla mappa proteomica posizioni in cui il loro punto isoelettrico assume valori di pH crescenti. Ma anche in seconda dimensione la migrazione di questi tre spot è ulteriormente risolta e i tre spot hanno anche un differente peso molecolare. Non solo, ma ciascuno dei tre spot è accompagnato do uno spot “satellite” che mostra lo stesso andamento degli spot maggiormente espressi.
Tali spot sono stati sistematicamente analizzati mediante spettrometria di massa MALDI-TOF e l’identificazione per tutti è stata la Vimentina, una proteina di circa 54 KDa e punto isoelettrico di circa 5 appartenente alla famiglia dei filamenti intermedi, coinvolta nell’ancoraggio degli organelli nel citosol e con importanti funzioni strutturali.
Il caratteristico pattern secondo cui erano risolti gli spot, ha portato a pensare che la Vimentina fosse soggetta a modificazioni post-traduzionali.
È stato condotto quindi uno studio sulle possibili acetilazioni e fosforilazioni (modificazioni post-traduzionali noti dalla banca dati UniProt).
I dati ottenuti forniscono solo un’indicazione sulla presenza di residui fosforilati e acetilati della Vimentina. Questi risultati richiederanno ulteriori indagini per confermare e approfondire i dati ottenuti.
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Informazioni tesi
Autore: | Antonio Rosato |
Tipo: | Laurea II ciclo (magistrale o specialistica) |
Anno: | 2012-13 |
Università: | Università degli Studi di Bari |
Facoltà: | Chimica |
Corso: | Scienze chimiche |
Relatore: | Gerardo Palazzo |
Lingua: | Italiano |
Num. pagine: | 117 |
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