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Intranuclear Trafficking of Fluorescent Hiv-1 Viral Particles

HIV-1 preferentially integrates in transcriptionally active regions of the host cellular chromatin independently from strong consensus sequences. To investigate whether the nuclear architecture may affect viral integration we have developed an experimental system where HIV-1 viral particles can be visualized within the nuclear compartment. Fluorescently labeled HIV-1 virions were engineered by fusing integrase, the viral protein that catalyzes the integration reaction, to fluorescent proteins. 3-D confocal microscopy allowed a detailed analysis of the spatial and temporal distribution of the pre-integration complexes (PICs) within the nucleus at different moments following infection; the fluorescently labeled PICs preferentially distribute in decondensed areas of the chromatin and in the nuclear periphery, while heterochromatin regions are largely disfavored. These observations provide a first indication of how the nuclear architecture may initially orient the selection of retroviral integration sites.

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2. CHAPTER 2 MATERIAL AND METHODS

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Informazioni tesi

  Autore: Alberto Albanese
  Tipo: Tesi di Dottorato
Dottorato in Biologia Molecolare
Anno: 2009
Docente/Relatore: Cereseto Anna
Istituito da: Scuola Normale Superiore di Pisa
Dipartimento: Biologia Molecolare
  Lingua: Inglese
  Num. pagine: 196

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Parole chiave

hiv-1
hiv-1 viral particles
particelle di hiv-1

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