Dna, paragrafi appunti disponibili

La volta precedente abbiamo parlato un po' di obesità ed ora volevo fare dei cenni, delle applicazioni ad un qualcosa di cui ci stiamo sempre più avvicinando. Ormai si parla di farmagenomica, nutrigenomica in quanto il mondo dell' “omica” è quello che si sta diffondendo sempre di più. La nutrigenomica in particolare ci riguardo da vicino perché è strettamente correlato con l'alimentazione, l'obesità e con queste tematiche che studiamo. La nutrigenomica studia l'interazione tra i nutrienti e il genoma umano; non è solo importante quello che mangiamo, ma...

Ci sono alcune cose che vi ho detto accennandovi e che oggi vorrei chiarire. Quando abbiamo fatto il DNA antico io vi ho detto che esiste la possibilità di un sequenziamento diretto, cioè viene amplificato ed ho la mia sequenza, cosa che solitamente si fa quando ho il mio DNA normale, oppure quello che generalmente si fa è un clonaggio prima di sequenziare il DNA io faccio un clonaggio del mio materiale di partenza che ha diversi vantaggi, poi faccio una sequenza di tutti i cloni. Il clonaggio ...

Consiste nella sintesi di oligonucleotidi corti complementari all’allele comune (più frequente nella popolazione) che viene miscelato con il DNA (ibridazione tra sonda e bersaglio) Questa tecnica consente di tipizzare tantissimi SNPs tutti insieme e avviene mediante l’utilizzo di microarray. Il nuovo Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0 caratterizza 1.8 milioni di marcatori genetici, inclusi più di 906,600 single nucleotide polymorphisms (SNPs) e più di 946,000 probes (sonde) per l’individuazione di copy number variation...

• RICOSTRUZIONE DELLE SEQUENZE: Se io devo analizzare ad esempio, i segmenti del DNA mitocondriale è abbastanza grande, io non riesco ad amplificare 300 paia di basi, non c’è la posso fare perché statisticamente ci sarà un danneggiamento all’interno di questa sequenza . Quindi si consiglia, di amplificare piccoli frammenti, sequenziare piccoli frammenti, che poi andranno ricostruiti, tipo puzzle in una sequenza unica.      • CHE PCR USO? La miglior PCR è la Real Time, che è una evoluzione della PCR competitiva. La PCR competitiva, è essenziale perché...

Il DNA, da dove si può estrarre? Generalmente parliamo di ossa, ma si può estrarre da qualsiasi tipo di tessuto fossile.Si può estrarre da: Ossa, denti, tessuti mummificati, coproliti. Quali sono i tessuti migliori?I tessuti migliori sono i DENTI, perché il dente ha lo smalto che protegge la parte interna (la dentina) dalle contaminazioni esterne. In più, il dente, grazie alla sega dentistica si può aprire, togliere tutta la polpa dentaria, e richiuderlo senza rovinare il reperto. Inoltre nel dente troviamo molte cellule. Ma purtroppo non...

I marcatori molecolari nello studio delle popolazioni umane (marcatori biallelici, VNTRs, STRs, SNPs): origine, tassi di mutazione e applicazioni Quello che facciamo prevalentemente in antropologia molecolare è studiare la variabilità a livello molecolare. Come la studiamo questa variabilità? Con i polimorfismi più importanti a livello molecolare, quindi a livello di DNA, che sono tutti questi che io vi ho scritto:

  È l'accoppiamento tra individui imparentati. È il caso dei matrimoni tra consanguinei. Deve essere misurato perché si ha sempre aumento della frequenza di omozigoti e diminuzione di eterozigoti. Si misura come coefficiente di imbreeding. Ovviamente l'imbreeding porta anche ad una diminuzione della fitness. L'aumento di omozigoti può portare a effetti deleteri, manifestazioni di patologie che non sarebbero manifestate. È il caso dell'emofilia dovuta ad un allele recessivo. Si parla di depressione da imbreeding. Ciò avviene anche negli animali, dove...

Si parla sempre di mutazione, in realtà sarebbe meglio parlare di una variazione del DNA, che può dare origine ad un polimorfismo se l'allele a frequenza minore ha una frequenza superiore all'1%. Se avessi un allele con frequenza inferiore all'1% quello non sarebbe un polimorfismo, ma sarebbe una variante allelica. Spesso invece il termine di mutazione si attribuisce a qualcosa di patogeno che deve essere eliminato. Sappiamo che la frequenza di mutazione è bassa e varia a seconda del tipo di mutazione. A noi interessano soprattutto le mutazioni che avvengono nelle...